天然气首先进入进料布气腔，气体首先撞击在支撑滤芯的支撑管（避免气流直接冲击滤芯，造成滤材的提前损坏）上，较大的固液颗粒被初步分离，并在重力的作用下沉降到容器底部（定期从排污口排出）。接着气体从外向里通过过滤聚结滤芯，固体颗粒被过滤介质截留，液体颗粒则因过滤介质聚结功能而在滤芯的内表面逐渐聚结长大。当液滴到达一定尺寸时会因气流的冲击作用从内表面脱落出来而进入滤芯内部流道而后进入汇流出料腔。在汇流出料腔内，较大的液珠依靠重力沉降分离出来，此外，在汇流出料腔，还设有分离元件，它能有效的捕集液滴，以防止出口液滴的被夹带，进一步提高分离效果。最后洁净的气体流出过滤分离器。随着燃气通过量的增加，沉积在滤芯上的颗粒会引起燃气过滤器压差的增加，当压差上升到规定值时（从压差计读出）说明滤芯已被严重堵塞，应该及时更换。过滤分离器起始压差不高于20KPa，更换压差不高于100KPa.

      高功率密度是燃气轮机过滤器的主要优点。一般同等功率、同等功率的柴油机是燃气轮机的三到五倍体积，而蒸汽轮机大约是燃气轮机的五到十倍体积。这是因为燃气过滤器本身具有精致的连续旋转热力循环结构。军舰的客舱较小，速度要求较高，而燃气轮机过滤器的体积小、功率大是合适的。

　 启动速度快是燃气过滤器的另一个优点。燃气过滤器的速度是三个动力系统中至高的。因为整个转子很轻，在起动机的帮助下，1-2分钟就能达到高速，所以燃气轮机的转速是三大动力系统至高的。因为转子的运动来自活塞的往复运动，柴油机的加速较慢。整个系统达到高功率输出可能需要一个小时，这是一个“反应慢”的汽轮机。舰艇在战时出动和反潜作战中的加减速性能直接受启动速度的影响。

    噪声的低频分量是燃气过滤器的第三个优点。高速旋转的燃气轮机会产生高频啸叫。柴油机的往复活塞会产生大量的低频机械振动噪声。在海洋容易传播的低频噪声确实是低频噪声。所以反潜舰动力系统不适合柴油机动力。